Az MGSZ irányító szervezete a Közgyűlés által 4 éves időtartamra választott Elnökség és a 2 éves időtartamra választott Elnök.
A jelenlegi Elnökség és az Elnök mandátuma egyaránt a 2012 évi Közgyűlésig szól.
Az MGSZ operatív teendőit az MGSZ Titkársága: az MGSZ Főtitkára és az MGSZ Titkárságának Asszisztense végzik.
A pénzügyi ellenőrzést az MGSZ három tagú Számvizsgáló Bizottsága látja el.